El Comité de Auditoría está integrado por tres miembros elegidos por el Consejo Directivo Universitario, para un período de tres años, actualmente está integrado así:
Nombre
Cargo
Jairo H. Cifuentes Madrid.
Secretario General
Juan Vianey Gómez
Phd. Profesor del Departamento de Contabilidad y Finanzas de la Seccional de Cali.
Jeanneth Ortega Hernández
Asesora externa, experta en temas de auditoria y contables.
El Comité de Auditoría se reúne como mínimo cuatro veces al año y podrá hacerlo cada vez que lo considere conveniente para el desarrollo de sus labores y cumplimiento de responsabilidades.