La Facultad de Teología cuenta con los siguientes Convenios de Cooperación Académica:

• Universidad Católica de Santiago de Chile
  
• Seminario Mayor de Tunja 
  
• ITEPAL – CELAM
  
• Centro Camiliano de Humanización y Pastoral de la Salud
  
• Seminario Mayor San Esteban de la Diócesis de Neiva
  
• Seminario Mayor de Girardot
  
• Instituto Superior de Estudios Teológicos Juan XXIII (ISET), Lima Perú
  
• Iglesia Luterana Sueca
  
• Fundación San Alfonso
  
• ITEPAL
  
• Instituto Internacional de Teología a Distancia (IITD)
  
• Pontificia Universidad Católica del Ecuador